Целью деятельности Центра является участие и организация мероприятий, способствующих развитию взаимовыгодного сотрудничества между Республикой Беларусь и Республикой Казахстан.

Основные направления деятельности центра содействие учебным заведениям, научным организациям, инновационным и промышленным предприятиям в расширении деловых, научных связей и контактов в области научных исследований и образования Республики Беларусь с аналогичными учреждениями и предприятиями Республики Казахстан, формирование эффективного механизма взаимодействия между Белорусской и Казахстанской сторонами при реализации совместных проектов и продвижении современных технологий и товаров на рынки, содействие научной и коммерческой кооперации, создание научно-образовательных инновационных партнерств высших учебных заведений и научных организаций, что обеспечит качественную подготовку кадров высшей научной квалификации и эффективную коммерциализацию высокотехнологичных разработок и инноваций.

Центр содействует координации деятельности Научно-образовательного консорциума между высшими учебными заведениями и НИИ Республики Беларусь и Республики Казахстан, реализации программ и проектов в рамках подписанных международных соглашений между Республикой Беларусь и Республикой Казахстан, инициированию новых научных проектов и исследований с подачей заявок на их финансирование на конкурсы, объявляемые государственными структурами и фондами каждой из стран, подготовке и проведению совместных конференций, выставок и других научных мероприятий, обмену научно-технической информацией о развивающихся научных направлениях, реализующихся проектах и разработках, выполняемых научными, проектными, инновационными организациями и ВУЗами двух стран, маркетингу инновационных технологий и разработок двух стран, представлению и взаимному продвижению научных проектов, разработок и технологий на рынки Республики Беларусь, Республики Казахстан и третьих стран.